La technologie d’électrophoresis de gel bidimensionnel et la technologie de spectrométrie de masse sont actuellement les méthodes les plus employées pour étudier la protéomique. La technologie d’électrophoresis de gel bidimensionnel emploie le point isoelectric de protéine et la différence moléculaire de poids pour distinguer diverses protéines. Bien qu’il soit difficile de distinguer les protéines de faible abondance par électrophoresis gel bidimensionnel, il a des exigences plus élevées pour le fonctionnement, mais son débit élevé, une bonne résolution et la reproductibilité, et ses caractéristiques d’être combiné avec la spectrométrie de masse en font les méthodes de recherche protéomique les plus populaires et fiables. La technologie d’électrophoresis de gel bidimensionnelle et les procédures de recherche protéomique basées sur la spectrométrie de masse sont la préparation d’échantillon→isoélectrique se concentrant→polyacrylamide gel électrophoresis→gel tacher→diquer les taches de protéines d’intérêt→in-gel digestion→mass spectrométrie analyse pour déterminer les peptides Empreinte digitale ou partielle séquence d’acide aminé→use base de données pour déterminer la protéine. La recherche sur la protéomique exige une séparation des protéines à haute résolution et des techniques précises et sensibles d’identification par spectrométrie de masse. La coloration des protéines dans l’électrophoresis gel affecte non seulement la résolution de la séparation des protéines, mais affecte également l’identification par spectrométrie de masse ultérieure. La coloration protéique peut être divisée en quatre catégories : coloration organique des reagents, coloration argentée, coloration fluorescente et coloration isotopique.
Unlu et coll. ont proposé une méthode d’analyse quantitative de protéomique d’affichage différentiel de fluorescence (F-2D-DIGE). L’électrophoresis différentiel de gel (DIGE) est une amélioration technique de 2-DE. Il combine la méthode de l’analyse multiple de fluorescence. Il sépare plusieurs échantillons étiquetés avec fluorescence différente sur le même gel et introduit le concept interne Sous-jacent. Les protéines des deux échantillons sont mélangées à différentes étiquettes fluorescentes pour effectuer 2-DE pour détecter l’expression de la protéine dans les deux échantillons, ce qui améliore considérablement la précision, la fiabilité et la répétabilité des résultats. Dans la technologie DIGE, chaque tache protéique a sa propre norme interne, et le logiciel peut automatiquement calibrer son expression selon la norme interne de chaque tache protéique pour s’assurer que les changements détectés d’abondance de protéine sont vrais. La technologie DIGE a été appliquée dans divers échantillons.